1、綜合工時合同到期，如果不屬于可簽訂無固定期限勞動合同的條件，單位可以不再續簽。由于不再續簽的責任在單位，屬于《勞動合同法》第四十六條第五款規定的情況，應根據勞動者已提供服務的年限，支付相應的經濟補償。
你簽的合同是年薪制，因此工時制已經無法不適用了，當然，前提是你所在公司已向勞動行政部門申請“不定時工時工作制或綜合計算工時工作制”，并經審批通過公示。如果沒有申請，那你們公司跟你簽年薪制合同本來就是違法的。
根據《中華人民共和國勞動合同法》規定，用人單位與勞動者解除勞動合同的，應當依照勞動合同法的相關規定支付經濟補償。
綜合計算工時制工時是指勞動者根據勞動合同的規定，為履行勞動義務而從事勞動的時間。
標準：綜合計算工作時間超過法定工作時間的部分，按不低于正常工作時間工資的150%支付加班工資；在法定節假日上班的，按不低于正常工作時間工資的300%支付加班工資。
工作時間不同 綜合工時制要求工作不超過8小時、每周工作不超過44小時、每周至少休息一天。標準工時制要求每日工作8小時、每周工作40小時的標準工時制。任何單位和個人都不得擅自延長職工的工作時間。
法律分析：綜合工時制是指分別以周、月、季、年等為周期，綜合計算工作時間，但其平均工作時間和平均周工作時間應與法定標準工作時間基本相同。中國勞動法規定的工時制度有三種，即標準工時制、綜合工時制和不定時工時制。
綜合計時制的工作時間有下列規定：該工作時間是分別以周、月、季、年等為周期，綜合計算的；但是其平均日和平均周的工作時間應與法定標準的工作時間基本相同，即每日工作時間不超過八小時、平均每周工作時間不超過四十四小時。
綜合工時制國家的規定是勞動者每天工作的時間是不得超過八個小時，每周工作的時間是不得超過四十四個小時，每周用人單位至少需要給予勞動者一天休息的時間。
實行綜合計算工時制的，每月平均工作時間也不得超過法律規定的法定標準工作時間。即每天不超過八小時，每周不超過44小時。每月工作時間，按實際周數和天數計算確定。
法律主觀：勞動法 關于工作時間的規定為： 我國的標準工作時間原則上為每天工作八小時。每周的工作時間最長不超過四十四小時。 按照計時制來計算工作時間的，用人單位也應按照每天八小時的工作時間來確定勞動報酬。
1、具體而言，如果一個周期內未滿，也就是說員工在該周期內沒有超過規定工作時間，則不需要向其支付加班費。但是有一點需要說明的是，在實際工作中，公司有可能制定了相關的內部制度，對于員工的工作時間安排有特殊規定。
2、有些企業因工作性質和生產特點不能實行標準工時制，應保證勞動者每天工作不超過8小時、每周工作不超過40小時、每周至少休息一天。
3、勞動法規定了相關加班工資。在法定節假日安排出勤，加班工資是300%，在周六日安排加班，加班工資是200%，平時工作日延長工作時間，加班工資是150%。無論是否綜合時制，每周不能超過40小時勞動時間。
1、單位實行綜合計算工時制需要向勞動行政部門報備，批準實施后，向員工公示，并明確什么崗位執行綜合計算工時，不滿足這些條件，單位的單方行為不受法律保護。
2、一般企業都是按標準工時制執行的，如果公司符合綜合工時制的條件，需要到當地人社部門進行備案，才可以執行綜合工時制。不過一般勞動者與企業簽訂勞動合同時，應該注明是何種工時制的。
3、只要在周期內加班時間不超過法定時數就不算違法，勞動法規定每個月加班不得超過36小時。你可以根據自己的情況算算超不超時。超時是違法行為，就算不超時也要支付你加班費的。不過綜合工時沒有2倍，只有5倍和3倍。
4、適合實行不定時工作制的職工。符合條件企業可以實行綜合工時制，不定時工時制，但需要經過勞動保障行政部門批準。
5、（二）企業實行不定時或綜合計算工時工作制的申請報告、實施方案、工時管理及工資支付規章制度。實施方案及規章制度需向本單位職工公示至少5個工作日，并提交公示反饋意見。